具有结合底物并使之转变成产物的作用，对结合酶来说，活性部位由为数不多的氨基酸残基和辅助因子的一部分组成，并具有一定的三维空间，有些具有相同催化作用的酶，其活性部位催化基团附近的氨基酸排列顺序常常相同或不同，辅酶或辅基参与酶活性中心的组成